More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3970 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3970  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
376 aa  778    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0988  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.61 
 
 
378 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2948  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.82 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0163396  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.87 
 
 
411 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14538  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7011  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.66 
 
 
382 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.07 
 
 
385 aa  358  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1922  hypothetical protein  41.76 
 
 
375 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1911  hypothetical protein  40.93 
 
 
375 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3313  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.86 
 
 
384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1327  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.36 
 
 
399 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0441  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.1 
 
 
401 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1850  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.67 
 
 
397 aa  288  8e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1248  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.7 
 
 
415 aa  283  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0362  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 
406 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 
386 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.47 
 
 
379 aa  276  4e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3165  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.76 
 
 
445 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2300  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.5 
 
 
414 aa  276  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.242601  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  39.89 
 
 
379 aa  275  7e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.73 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37799  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.37 
 
 
380 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.24 
 
 
386 aa  272  7e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.37 
 
 
379 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4293  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.22 
 
 
383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  40.05 
 
 
379 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  40.05 
 
 
379 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  40.05 
 
 
379 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.31 
 
 
386 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  39.79 
 
 
379 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  39.79 
 
 
379 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  39.79 
 
 
379 aa  265  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  39.79 
 
 
379 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.47 
 
 
380 aa  265  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  39.52 
 
 
379 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  38.73 
 
 
379 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.53 
 
 
382 aa  263  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.17 
 
 
379 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2336  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.95 
 
 
385 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  38.1 
 
 
379 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  38.1 
 
 
379 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.99 
 
 
379 aa  262  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  38.73 
 
 
377 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.52 
 
 
374 aa  262  8.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.73 
 
 
379 aa  259  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.11 
 
 
380 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6770  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.88 
 
 
390 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210456  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  38.61 
 
 
377 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.07 
 
 
377 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.99 
 
 
379 aa  255  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.14 
 
 
379 aa  252  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1570  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.73 
 
 
383 aa  252  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.3 
 
 
381 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1555  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.33 
 
 
383 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.2 
 
 
394 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.36 
 
 
383 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0345355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2279  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.84 
 
 
383 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.27 
 
 
377 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.27 
 
 
377 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.99 
 
 
379 aa  249  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.58 
 
 
383 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3574  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.44 
 
 
377 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  39.1 
 
 
379 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.1 
 
 
389 aa  249  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  36.87 
 
 
378 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3492  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.58 
 
 
383 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.77 
 
 
383 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.73 
 
 
377 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.99 
 
 
380 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.14 
 
 
389 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.51 
 
 
385 aa  246  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.6 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  35.81 
 
 
380 aa  246  6e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.83 
 
 
377 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.47 
 
 
381 aa  246  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.37 
 
 
377 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2885  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.32 
 
 
383 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.37 
 
 
377 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37 
 
 
375 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.67 
 
 
378 aa  244  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.39 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  37.01 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.39 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.33 
 
 
379 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.54 
 
 
380 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  35.39 
 
 
379 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.56 
 
 
377 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  36.56 
 
 
377 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.56 
 
 
377 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.9 
 
 
400 aa  242  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.98 
 
 
382 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.12 
 
 
375 aa  242  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.2 
 
 
381 aa  242  9e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  36.7 
 
 
379 aa  241  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  36.84 
 
 
381 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  36.84 
 
 
381 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.54 
 
 
402 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.77 
 
 
383 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  38.56 
 
 
378 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  36.7 
 
 
379 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  36.84 
 
 
381 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>