29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3862 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  100 
 
 		 99 aa  185  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  48.94 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2686  CsbD family protein  32.94 
 
 		 98 aa  48.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0451307  normal  0.845965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  39.68 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  37.31 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  37.31 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7180  CsbD family protein  36.08 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  38.81 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  43.75 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  39.68 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  36.92 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  36.92 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  48.94 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  38.46 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  38.46 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  47.83 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  38.46 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  46.81 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  46.81 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  47.83 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  35.82 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  37.7 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  42.55 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  37.7 
 
 		 63 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  47.73 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  43.4 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  44.23 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  32.08 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  32.08 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>