26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2743 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2743  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1396  hypothetical protein  31.2 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3184  hypothetical protein  30.95 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  50 
 
 
287 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3881  hypothetical protein  52.27 
 
 
285 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0964  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
281 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  50 
 
 
274 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0295  Rhomboid family protein  43.24 
 
 
317 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  43.59 
 
 
290 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0788  hypothetical protein  27.41 
 
 
160 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.449202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  43.24 
 
 
291 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  40.48 
 
 
289 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  40.48 
 
 
289 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  40.48 
 
 
289 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  40.48 
 
 
284 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  43.24 
 
 
306 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  36.54 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  43.24 
 
 
306 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  28.99 
 
 
303 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  40.54 
 
 
287 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  28.99 
 
 
303 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  41.03 
 
 
279 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  43.24 
 
 
298 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  39.47 
 
 
292 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  40.54 
 
 
286 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  37.84 
 
 
356 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>