49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1792 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1328    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  37.28 
 
 		 599 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  38.34 
 
 		 575 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  38.34 
 
 		 643 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  35.98 
 
 		 642 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  37.07 
 
 		 616 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  36.66 
 
 		 634 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  36.91 
 
 		 612 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  37.4 
 
 		 614 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  36.77 
 
 		 631 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  37.68 
 
 		 639 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  36.83 
 
 		 627 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  37.13 
 
 		 639 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  36.7 
 
 		 615 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  36.51 
 
 		 593 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  36.91 
 
 		 615 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  36.73 
 
 		 615 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  36.15 
 
 		 617 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  36.32 
 
 		 621 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  37.5 
 
 		 660 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  35.26 
 
 		 595 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  36.32 
 
 		 680 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  36.2 
 
 		 569 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  35.91 
 
 		 623 aa  365  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  47.04 
 
 		 318 aa  273  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  26.79 
 
 		 624 aa  201  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 		 861 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3687  putative helicase  33.33 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  29.01 
 
 		 569 aa  125  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  30.18 
 
 		 560 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  29.25 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  29.86 
 
 		 570 aa  115  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  26.69 
 
 		 551 aa  106  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3051  protein of unknown function DUF1528  29.28 
 
 		 478 aa  102  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0065  type IV conjugative transfer system protein TraI  29.7 
 
 		 990 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4411  hypothetical protein  28.33 
 
 		 308 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  24.31 
 
 		 1096 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  33.33 
 
 		 282 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4265  relaxase  25 
 
 		 941 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350547  normal  0.8702 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  23.27 
 
 		 611 aa  58.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51640  hypothetical protein  31.78 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000358498  hitchhiker  0.000035713 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  22.16 
 
 		 597 aa  57.4  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  22.44 
 
 		 721 aa  54.7  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2994  hypothetical protein  24.19 
 
 		 445 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2854  hypothetical protein  23.26 
 
 		 445 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4267  relaxase  23.42 
 
 		 642 aa  50.8  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  21.45 
 
 		 549 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25110  hypothetical protein  32.65 
 
 		 97 aa  47.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 		 320 aa  44.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>