35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1762 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1762  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  974    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0658  hypothetical protein  42.21 
 
 		 513 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2351  hypothetical protein  40.42 
 
 		 472 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000118679  unclonable  0.000000241983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4088  hypothetical protein  41.97 
 
 		 498 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1166  hypothetical protein  39.62 
 
 		 472 aa  322  7e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0335  hypothetical protein  42.37 
 
 		 498 aa  322  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4171  hypothetical protein  43.59 
 
 		 498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3422  putative secreted protein  39.63 
 
 		 469 aa  319  7e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1400  putative secreted protein  39.46 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1258  putative secreted protein  39.46 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1628  putative secreted protein  38.88 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4177  putative secreted protein  38.89 
 
 		 469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.113343  normal  0.692666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1186  hypothetical protein  39.12 
 
 		 472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2392  hypothetical protein  38.96 
 
 		 477 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1444  hypothetical protein  36.71 
 
 		 494 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2188  hypothetical protein  38.76 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0437  putative secreted protein  38.41 
 
 		 466 aa  311  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2857  hypothetical protein  38.56 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.560129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0950  hypothetical protein  38.62 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0681  hypothetical protein  39.39 
 
 		 489 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0504  hypothetical protein  38 
 
 		 491 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0861  hypothetical protein  38.26 
 
 		 498 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3707  hypothetical protein  38.24 
 
 		 505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4513  hypothetical protein  35.53 
 
 		 501 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59920  hypothetical protein  36.64 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000417917  hitchhiker  0.0000000000150468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3328  hypothetical protein  35.55 
 
 		 502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2946  hypothetical protein  35.49 
 
 		 502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3021  hypothetical protein  34.85 
 
 		 504 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333759  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3928  hypothetical protein  36.45 
 
 		 494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.472883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36260  hypothetical protein  33.76 
 
 		 495 aa  251  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0646  hypothetical protein  36.75 
 
 		 473 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2757  hypothetical protein  42.68 
 
 		 484 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249947  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2390  hypothetical protein  36.96 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1024  hypothetical protein  30.35 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1062  hypothetical protein  29.84 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>