48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0430 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0430  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 		 106 aa  204  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000201128 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1927  exonuclease VII small subunit  71.29 
 
 		 100 aa  125  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.894899  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.44 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.23 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.33 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26440  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.53 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102851  normal  0.416491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.48 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.46 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4108  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0286083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4634  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.67 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4339  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0975539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2076  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.33 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624924  normal  0.162947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31510  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.39 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0551924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3117  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.03656  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.89 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3069  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.63 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8484  Exonuclease VII small subunit-like protein  52.63 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0128  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0877  exonuclease VII, small subunit  45.71 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1073  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.88 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0822  exonuclease VII small subunit  43.66 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0725  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.91 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5540  Exonuclease VII small subunit  50.88 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.83 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11129  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2551  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000943979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1005  Exonuclease VII small subunit  50.94 
 
 		 72 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0467  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.88 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0937  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.94 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1088  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.08 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0317888  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.47 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.28 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.99 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.36 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0847  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.28 
 
 		 110 aa  42  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1121  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.62 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.99 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.51 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.51 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.51 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.25 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.04 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.67 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.85 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1669  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.38 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000880334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>