20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2270 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2270  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3057  SCP-like extracellular  61.42 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1216  SCP-like extracellular  62.78 
 
 		 205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1168  hypothetical protein  62.03 
 
 		 217 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.452749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0292  Allergen V5/Tpx-1 family protein  57.07 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0796  Allergen V5/Tpx-1 related protein  57.06 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4778  Allergen V5/Tpx-1 related  44.44 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4777  Allergen V5/Tpx-1 related  46.67 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  42.62 
 
 		 293 aa  144  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.44 
 
 		 242 aa  141  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1620  Allergen V5/Tpx-1 related  47.02 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1475  SCP-like extracellular  45.45 
 
 		 192 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0179083 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0824  putative lipoprotein  37.26 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000106095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5182  SCP-like extracellular  36.57 
 
 		 309 aa  108  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.51 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  34.51 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.48 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3270  allergen V5/TPX-1 family protein  24.18 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  32.98 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  32.5 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>