More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1603 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1603  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
335 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00422679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1211  electron transfer flavoprotein beta-subunit  86.11 
 
 
270 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2067  electron transfer flavoprotein subunit beta  80.09 
 
 
270 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107752  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2258  electron transfer flavoprotein subunit beta  81.11 
 
 
271 aa  355  5e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00448777  hitchhiker  0.0000000000493094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1466  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  78.7 
 
 
270 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2872  electron transfer flavoprotein  77.98 
 
 
270 aa  354  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.604288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2716  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  77.31 
 
 
270 aa  353  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2928  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  77.78 
 
 
270 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2787  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  77.78 
 
 
270 aa  352  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1357  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  77.78 
 
 
270 aa  352  7e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.540226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1500  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  76.85 
 
 
270 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2133  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  76.85 
 
 
270 aa  349  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000214154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2416  electron transfer flavoprotein beta-subunit  78.7 
 
 
270 aa  341  8e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0572  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.58 
 
 
271 aa  341  9e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.46 
 
 
270 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0683  electron transfer flavoprotein subunit beta  72.94 
 
 
272 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0348502  normal  0.693464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2797  electron transfer flavoprotein, beta subunit  77.06 
 
 
272 aa  339  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000537457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0058  electron transfer flavoprotein subunit beta  52.74 
 
 
267 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2776  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.26 
 
 
277 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1436  electron transfer flavoprotein subunit beta FixA  50 
 
 
282 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000812152  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2313  electron transfer flavoprotein beta-subunit  48.58 
 
 
282 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.842048  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7739  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.53 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1538  electron transfer flavoprotein beta-subunit  52.76 
 
 
265 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.374456  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1196  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50.47 
 
 
280 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317392 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1480  electron transfer flavoprotein, beta subunit  50.47 
 
 
280 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4448  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.3 
 
 
294 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1368  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.29 
 
 
283 aa  216  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2267  electron transfer flavoprotein subunit beta  49.53 
 
 
283 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10520  Electron transfer flavoprotein beta-subunit, FixA  49.05 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  77.24 
 
 
652 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5086  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.83 
 
 
281 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.865111  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0984  electron transfer flavoprotein subunit beta  48.83 
 
 
298 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.0549625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1088  electron transfer flavoprotein beta-subunit  48.36 
 
 
281 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.44815  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1555  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.53 
 
 
284 aa  209  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0538091  normal  0.961972 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1935  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  47 
 
 
266 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988046  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  76.42 
 
 
661 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.8 
 
 
284 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1545  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  46.3 
 
 
261 aa  206  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.25 
 
 
262 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5872  protein fixA  47.91 
 
 
281 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0352817  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4929  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.76 
 
 
282 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0487  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.02 
 
 
284 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0142  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.48 
 
 
282 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1193  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.93 
 
 
285 aa  202  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.40527  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1262  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  47.93 
 
 
285 aa  202  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.28 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  71.21 
 
 
659 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2583  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  48.11 
 
 
259 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2285  electron transfer flavoprotein beta-subunit  48.11 
 
 
259 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  74.79 
 
 
661 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3577  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.29 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161962  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_002950  PG1077  electron transfer flavoprotein, beta subunit  47.85 
 
 
261 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.45 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3596  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50.24 
 
 
278 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  75.86 
 
 
658 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0956  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.29 
 
 
281 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.660702  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  72.88 
 
 
658 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3616  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.51 
 
 
283 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.093225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  74.36 
 
 
655 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4015  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.29 
 
 
284 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1485  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.54 
 
 
262 aa  187  3e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0507333  normal  0.41836 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.19 
 
 
610 aa  186  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.06 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  70.43 
 
 
658 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6228  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.2 
 
 
295 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1355  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  42.02 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000258852  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  64.66 
 
 
655 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  66.95 
 
 
656 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  65.25 
 
 
656 aa  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0303  electron transfer flavoprotein, beta subunit  41.83 
 
 
262 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0308  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  41.83 
 
 
262 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.01 
 
 
601 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0367  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.55 
 
 
262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969021  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0130  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.71 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.999111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  61.67 
 
 
663 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  62.93 
 
 
663 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1315  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.42 
 
 
262 aa  159  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.820816  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  39.25 
 
 
259 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  66.67 
 
 
664 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  66.67 
 
 
664 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3687  electron transfer flavoprotein beta-subunit  42.86 
 
 
265 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0540  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.97 
 
 
589 aa  152  8e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.448343  normal  0.108603 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  55.28 
 
 
676 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0477  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.64 
 
 
288 aa  142  7e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000602402  decreased coverage  0.000244781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  52.54 
 
 
718 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2371  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.25 
 
 
264 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.829288  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  52.54 
 
 
732 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2133  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.71 
 
 
264 aa  136  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0646  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.79 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413124  hitchhiker  0.00160368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2200  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  40.53 
 
 
259 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1835  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.12 
 
 
257 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.163048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3166  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.49 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0777  electron transfer flavoprotein, beta subunit  41.94 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.16 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  49.58 
 
 
1388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.15 
 
 
259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  47.01 
 
 
678 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2299  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.97 
 
 
258 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  37.95 
 
 
259 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  46.67 
 
 
716 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>