28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0590 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0590  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  254  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2777  hypothetical protein  75 
 
 		 136 aa  189  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2246  hypothetical protein  68.97 
 
 		 126 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0107  hypothetical protein  62.2 
 
 		 126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.28143  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2813  XRE family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0346  XRE family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1322  hypothetical protein  54.05 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1219  hypothetical protein  54.13 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126149  normal  0.0261172 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2856  hypothetical protein  52.25 
 
 		 227 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7304  hypothetical protein  52.68 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3225  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0639  hypothetical protein  47.32 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4130  hypothetical protein  43.75 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000962953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0368  hypothetical protein  44.64 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2931  hypothetical protein  41.07 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2804  hypothetical protein  36.21 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0781279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3335  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00388895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1958  hypothetical protein  38.89 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1717  hypothetical protein  37.01 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1343  hypothetical protein  34.65 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.929082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2091  hypothetical protein  35.45 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4354  hypothetical protein  37 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00239185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51020  hypothetical protein  36.73 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127493  hitchhiker  0.000000230251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  33.01 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  31 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  31.07 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  24.43 
 
 		 131 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>