More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0189 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0189  Thioredoxin domain  100 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  60.69 
 
 		 150 aa  201  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1543  Thioredoxin domain protein  63.31 
 
 		 148 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3446  thioredoxin family protein, selenocysteine-containing  63.57 
 
 		 150 aa  190  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  37.5 
 
 		 165 aa  105  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  39.58 
 
 		 144 aa  100  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  36.11 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  35.51 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  37.93 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  38.73 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  38.41 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  33.09 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  33.09 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  37.5 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  35.92 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4096  thioredoxin domain-containing protein  33.8 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  37.32 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  36.11 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  34.69 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  36.81 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  33.57 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  34.75 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  34.29 
 
 		 170 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  36.88 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  36.11 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  36.88 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  35.71 
 
 		 144 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3451  thioredoxin  36.88 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.560369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  32.88 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  31.29 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  30.71 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  33.57 
 
 		 170 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  33.57 
 
 		 170 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  36.96 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  33.57 
 
 		 170 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  36.96 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  36.96 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  36.96 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  34.06 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  34.06 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  33.33 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  36.96 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  32.61 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  34.31 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  33.57 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  33.81 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  37.78 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  29.86 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  34.78 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  37.5 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  35.71 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  35.07 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  32.62 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  34.78 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  35.51 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  35.51 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  34.01 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  45.74 
 
 		 259 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  29.86 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  37.04 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  36.23 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  37.23 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  39.39 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  35.71 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  33.33 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  35 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  37.06 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  33.33 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  32.39 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  32.85 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  34.78 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  31.51 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  35 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  44.57 
 
 		 259 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  38 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  31.43 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  33.09 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  32.62 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  43.33 
 
 		 107 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  40.38 
 
 		 257 aa  84.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  33.09 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  41.49 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  31.62 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  41.05 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0306  thioredoxin  32.61 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00417001  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  43.82 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  42.22 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  31.88 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  32.19 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  31.88 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>