More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1898 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1898  Chorismate binding-like protein  100 
 
 		 464 aa  904    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0230156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.72 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.87 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3570  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.92 
 
 		 447 aa  296  6e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.89 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.96 
 
 		 457 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  41.04 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1132  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.15 
 
 		 474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.2 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.95 
 
 		 461 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.54 
 
 		 447 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  43.93 
 
 		 447 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.96 
 
 		 466 aa  277  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  43.16 
 
 		 447 aa  276  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.52 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.49 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.18 
 
 		 455 aa  272  9e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.99 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.53 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4201  para-aminobenzoate synthase component I  46.72 
 
 		 462 aa  271  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0880526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.53 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.58 
 
 		 447 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.15 
 
 		 470 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.72 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.93 
 
 		 470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  41.79 
 
 		 453 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.77 
 
 		 453 aa  266  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.77 
 
 		 453 aa  266  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40 
 
 		 452 aa  266  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.94 
 
 		 466 aa  265  8.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.7 
 
 		 470 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  38.77 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.39 
 
 		 457 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.37 
 
 		 470 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  38.04 
 
 		 453 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.18 
 
 		 458 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  38.46 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  38.55 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  38.18 
 
 		 458 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  38.18 
 
 		 458 aa  264  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  38.18 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.15 
 
 		 473 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  38.55 
 
 		 453 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  38.55 
 
 		 453 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.71 
 
 		 450 aa  263  6.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  40.49 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.62 
 
 		 466 aa  262  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  38.67 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  38.33 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  37.22 
 
 		 456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.45 
 
 		 466 aa  259  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  44.85 
 
 		 408 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.73 
 
 		 471 aa  259  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  39.86 
 
 		 495 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.05 
 
 		 474 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  36.55 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.11 
 
 		 460 aa  255  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.07 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.31 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  39.07 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.07 
 
 		 454 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.77 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.85 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.3 
 
 		 469 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  36.89 
 
 		 467 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  36.04 
 
 		 509 aa  252  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.09 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  37.01 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2603  anthranilate synthase  37.28 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0445726  normal  0.0808647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.81 
 
 		 467 aa  251  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.78 
 
 		 448 aa  249  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.28 
 
 		 480 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.33 
 
 		 458 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.46 
 
 		 476 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.85 
 
 		 467 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.76 
 
 		 456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.69 
 
 		 480 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  39.57 
 
 		 462 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.57 
 
 		 480 aa  246  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.14 
 
 		 477 aa  246  8e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.94 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.3 
 
 		 474 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.13 
 
 		 460 aa  242  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0506  anthranilate synthase component I  39.32 
 
 		 505 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  35.44 
 
 		 476 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  38.43 
 
 		 496 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.03 
 
 		 490 aa  236  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  33.41 
 
 		 497 aa  236  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1666  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.76 
 
 		 700 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0690  Anthranilate synthase  34.57 
 
 		 465 aa  232  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.37 
 
 		 732 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3368  anthranilate synthase component I  38.71 
 
 		 493 aa  230  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.082923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2239  anthranilate synthase  35.89 
 
 		 434 aa  229  7e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1137  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.69 
 
 		 476 aa  229  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.174  normal  0.645122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  36.71 
 
 		 491 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  37.74 
 
 		 487 aa  229  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5398  anthranilate synthase component I  40.18 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.89 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  32.65 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.54 
 
 		 509 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>