41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4863 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 132 aa  258  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  39.67 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  38.64 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  38.64 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  38.64 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  35.38 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  35.94 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  40 
 
 		 147 aa  57  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  38.33 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  33.88 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  32.03 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  36.84 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  51.47 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  36.52 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  34.45 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  37.76 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  36.08 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  46.48 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  36.07 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  25.44 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  32.5 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  38.69 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  25.44 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  25.44 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  28.32 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  25.44 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  25.44 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  25.44 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  25.44 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  25.44 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  25.44 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  23.14 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  42.42 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  24.79 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  24.79 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  24.35 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  45.31 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  45.21 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  27.5 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  23.68 
 
 		 115 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>