22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4828 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  227  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  64.55 
 
 		 110 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  64.55 
 
 		 110 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  64.81 
 
 		 119 aa  141  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  63.64 
 
 		 110 aa  141  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3751  hypothetical protein  56.36 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  56.36 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  45.45 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3346  hypothetical protein  36.36 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0359  hypothetical protein  35.71 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0534  hypothetical protein  36.19 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.82 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0620  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.94 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0026  hypothetical protein  33.64 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4848  hypothetical protein  35.14 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.988935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4632  hypothetical protein  32.43 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  0.0973138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1143  hypothetical protein  31.4 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  25.71 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4361  hypothetical protein  39.39 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.014453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>