17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4361 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4361  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  214  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4632  hypothetical protein  85.32 
 
 
109 aa  184  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  0.0973138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0026  hypothetical protein  64.22 
 
 
109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282024  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  56.88 
 
 
135 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3751  hypothetical protein  40.54 
 
 
115 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  36.04 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  33.64 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  33.64 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.19 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  31.78 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.52 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5975  hypothetical protein  27.78 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.903409  normal  0.674461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2332  hypothetical protein  28.04 
 
 
112 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1143  hypothetical protein  30.1 
 
 
128 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000327327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  30 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>