38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2812 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2812  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  318  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03340  hypothetical protein  73.68 
 
 		 91 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0327  hypothetical protein  49.47 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0337  hypothetical protein  49.47 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0316  hypothetical protein  49.47 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2792  hypothetical protein  49.44 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3323  hypothetical protein  56.41 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.915522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3533  hypothetical protein  45.26 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.344745  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2982  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2903  hypothetical protein  39.74 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.520139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1869  hypothetical protein  41.98 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04330  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  48.68 
 
 		 408 aa  65.1  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0867  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2325  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000715446 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2195  hypothetical protein  50.63 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.412323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0270  hypothetical protein  52.5 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00906626  decreased coverage  0.0012708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4257  hypothetical protein  42.57 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182743  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0093  hypothetical protein  38.36 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.745488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08070  hypothetical protein  40.66 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153782  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14420  hypothetical protein  45.61 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0734  hypothetical protein  41.56 
 
 		 87 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184281  normal  0.283478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0740  hypothetical protein  41.56 
 
 		 87 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0754  hypothetical protein  41.56 
 
 		 87 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709746  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1342  hypothetical protein  47.22 
 
 		 127 aa  51.6  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0754  hypothetical protein  38.3 
 
 		 118 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990253  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2744  hypothetical protein  43.66 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3189  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3225  hypothetical protein  38.67 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1931  hypothetical protein  46.55 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154345  hitchhiker  0.0000000596513 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2010  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3469  hypothetical protein  48.28 
 
 		 81 aa  45.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6119  hypothetical protein  39.19 
 
 		 81 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2220  hypothetical protein  39.19 
 
 		 81 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3000  hypothetical protein  37.33 
 
 		 87 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4990  hypothetical protein  41.18 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.974642  normal  0.779534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5043  hypothetical protein  41.18 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.902742  normal  0.657032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4530  hypothetical protein  41.18 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3242  hypothetical protein  41.27 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>