26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14420 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_14420  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  193  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2325  hypothetical protein  55.79 
 
 
119 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000715446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0740  hypothetical protein  56.63 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0754  hypothetical protein  56.63 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709746  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0734  hypothetical protein  56.63 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184281  normal  0.283478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3242  hypothetical protein  60.87 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1342  hypothetical protein  55.26 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2010  hypothetical protein  54.32 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0374  hypothetical protein  44.94 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.403267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3189  hypothetical protein  45.88 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766246  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1889  hypothetical protein  45.24 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503768  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6119  hypothetical protein  46.67 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2220  hypothetical protein  46.67 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189609  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3000  hypothetical protein  45.24 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664026  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3225  hypothetical protein  45.24 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2744  hypothetical protein  43.04 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2903  hypothetical protein  42.11 
 
 
84 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.520139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0093  hypothetical protein  43.59 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.745488  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3469  hypothetical protein  48 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4459  hypothetical protein  37.37 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218625  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1931  hypothetical protein  49.18 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154345  hitchhiker  0.0000000596513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2812  hypothetical protein  45.61 
 
 
165 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4860  hypothetical protein  51.32 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2241  hypothetical protein  32.39 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0557  hypothetical protein  37.63 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3569  hypothetical protein  29.47 
 
 
94 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>