28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2325 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2325  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  233  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000715446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14420  hypothetical protein  55.79 
 
 
98 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1342  hypothetical protein  68 
 
 
127 aa  89.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0734  hypothetical protein  58.44 
 
 
87 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184281  normal  0.283478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0740  hypothetical protein  58.44 
 
 
87 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0754  hypothetical protein  58.44 
 
 
87 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709746  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3242  hypothetical protein  56.63 
 
 
116 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2010  hypothetical protein  63.01 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2744  hypothetical protein  42.5 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4860  hypothetical protein  60.81 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3189  hypothetical protein  43.42 
 
 
87 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766246  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3000  hypothetical protein  43.42 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664026  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2812  hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3225  hypothetical protein  43.42 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0374  hypothetical protein  44.44 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.403267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3469  hypothetical protein  44.74 
 
 
81 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6119  hypothetical protein  39.47 
 
 
81 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2220  hypothetical protein  39.47 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189609  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1889  hypothetical protein  36.9 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2241  hypothetical protein  36.71 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2903  hypothetical protein  35.62 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.520139  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1931  hypothetical protein  48.21 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154345  hitchhiker  0.0000000596513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0093  hypothetical protein  34.67 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.745488  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0557  hypothetical protein  37.08 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0961  hypothetical protein  42.47 
 
 
90 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.570752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4459  hypothetical protein  34.83 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218625  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1707  hypothetical protein  34.25 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123463  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2383  hypothetical protein  34.25 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0573572  normal  0.991309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>