25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0740 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0740  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0754  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709746  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0734  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184281  normal  0.283478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3242  hypothetical protein  70.31 
 
 
116 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2325  hypothetical protein  58.44 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000715446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14420  hypothetical protein  56.63 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1342  hypothetical protein  58.67 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2903  hypothetical protein  38.36 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.520139  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2010  hypothetical protein  58.11 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0374  hypothetical protein  48.65 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.403267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2744  hypothetical protein  44.74 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0093  hypothetical protein  40.79 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.745488  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3000  hypothetical protein  45.12 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664026  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3189  hypothetical protein  47.3 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766246  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3225  hypothetical protein  45.12 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1889  hypothetical protein  41.89 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503768  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2812  hypothetical protein  41.56 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2241  hypothetical protein  38.67 
 
 
101 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0557  hypothetical protein  40.23 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6119  hypothetical protein  38.46 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3469  hypothetical protein  42.31 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4860  hypothetical protein  63.33 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1931  hypothetical protein  45.9 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154345  hitchhiker  0.0000000596513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2220  hypothetical protein  38.67 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189609  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3333  hypothetical protein  31.71 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>