71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1342 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1342  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  243  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2010  hypothetical protein  59.17 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2325  hypothetical protein  68 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000715446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14420  hypothetical protein  55.26 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0734  hypothetical protein  58.67 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184281  normal  0.283478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0754  hypothetical protein  58.67 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709746  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0740  hypothetical protein  58.67 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3242  hypothetical protein  55.56 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2744  hypothetical protein  48.72 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4860  hypothetical protein  61.54 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3189  hypothetical protein  46.84 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3000  hypothetical protein  45.68 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3225  hypothetical protein  45.68 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7189  hypothetical protein  60.87 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1889  hypothetical protein  45.57 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503768  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0891  hypothetical protein  70.59 
 
 		 50 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12631  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1189  hypothetical protein  65.85 
 
 		 53 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.147623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1059  hypothetical protein  65.85 
 
 		 53 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.917626  normal  0.121737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0983  hypothetical protein  65.85 
 
 		 53 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1844  hypothetical protein  71.43 
 
 		 46 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236914  normal  0.0255344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3952  hypothetical protein  71.43 
 
 		 50 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1931  hypothetical protein  53.33 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154345  hitchhiker  0.0000000596513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0374  hypothetical protein  44.3 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.403267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5457  hypothetical protein  58.14 
 
 		 53 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148769 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1820  hypothetical protein  72.73 
 
 		 56 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.510748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0257  hypothetical protein  54.55 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.66334  normal  0.0569964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2812  hypothetical protein  47.22 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3021  hypothetical protein  57.14 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1205  hypothetical protein  62.5 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000714156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2220  hypothetical protein  42.67 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5346  hypothetical protein  67.65 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6119  hypothetical protein  42.67 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2525  hypothetical protein  57.5 
 
 		 52 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.269298  normal  0.238571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3589  hypothetical protein  57.5 
 
 		 52 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3546  hypothetical protein  57.14 
 
 		 53 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00336349 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1550  hypothetical protein  36 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259641  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2550  hypothetical protein  65.79 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0448  hypothetical protein  58.33 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1234  Uncharacterized conserved protein UCP037205  57.5 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0334924  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1226  hypothetical protein  62.86 
 
 		 55 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3466  hypothetical protein  72.73 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.903775  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0400  hypothetical protein  58.33 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0093  hypothetical protein  35.9 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.745488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2903  hypothetical protein  41.94 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.520139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3469  hypothetical protein  48.1 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3104  hypothetical protein  60 
 
 		 46 aa  53.9  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45996  predicted protein  56.1 
 
 		 366 aa  53.9  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1604  hypothetical protein  45.65 
 
 		 53 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.490705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1752  hypothetical protein  62.86 
 
 		 53 aa  53.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.790866  decreased coverage  0.000944822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2054  hypothetical protein  54.29 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1607  hypothetical protein  48.65 
 
 		 53 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0772  hypothetical protein  57.78 
 
 		 47 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2241  hypothetical protein  39.44 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35862  predicted protein  56.1 
 
 		 206 aa  51.6  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5832  hypothetical protein  56.1 
 
 		 56 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4250  hypothetical protein  47.62 
 
 		 53 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0150  zinc finger protein  50 
 
 		 49 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1002  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0778  hypothetical protein  55.56 
 
 		 46 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0999  hypothetical protein  61.76 
 
 		 46 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.179873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1251  hypothetical protein  54.84 
 
 		 55 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000641803 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0725  hypothetical protein  58.82 
 
 		 43 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07811  hypothetical protein  48.65 
 
 		 44 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32809  predicted protein  52.5 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0902921 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1060  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15631  hypothetical protein  57.58 
 
 		 39 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.667904  normal  0.580622 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1439  hypothetical protein  60 
 
 		 51 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.498137  normal  0.11271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1774  hypothetical protein  67.86 
 
 		 53 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0399  hypothetical protein  45.95 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.964874  hitchhiker  0.000444123 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0422  hypothetical protein  50 
 
 		 41 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.787118  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0447  hypothetical protein  45.95 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>