33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3000 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3000  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  176  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3225  hypothetical protein  98.84 
 
 		 87 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3189  hypothetical protein  95.35 
 
 		 87 aa  168  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2744  hypothetical protein  83.13 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0374  hypothetical protein  79.76 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.403267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1889  hypothetical protein  73.81 
 
 		 90 aa  130  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503768  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3337  hypothetical protein  48.78 
 
 		 91 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2383  hypothetical protein  46.99 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0573572  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3071  hypothetical protein  46.51 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0905739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2903  hypothetical protein  44.05 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.520139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2430  hypothetical protein  43.9 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213345  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3569  hypothetical protein  46.99 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0961  hypothetical protein  42.11 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.570752 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1707  hypothetical protein  42.68 
 
 		 89 aa  67  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123463  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14420  hypothetical protein  45.24 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1562  hypothetical protein  39.33 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2241  hypothetical protein  45.57 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2325  hypothetical protein  43.42 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000715446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4459  hypothetical protein  40.7 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218625  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0734  hypothetical protein  45.12 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184281  normal  0.283478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0754  hypothetical protein  45.12 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709746  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0740  hypothetical protein  45.12 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0093  hypothetical protein  39.29 
 
 		 81 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.745488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3333  hypothetical protein  35.9 
 
 		 106 aa  52  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1342  hypothetical protein  45.57 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2220  hypothetical protein  43.04 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1931  hypothetical protein  45.59 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154345  hitchhiker  0.0000000596513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0557  hypothetical protein  41.56 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3242  hypothetical protein  36.62 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6119  hypothetical protein  42.31 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2812  hypothetical protein  37.33 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2010  hypothetical protein  39.76 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3469  hypothetical protein  37.35 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>