51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1059 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1059  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.917626  normal  0.121737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1189  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.147623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0983  hypothetical protein  86.79 
 
 		 53 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3466  hypothetical protein  95.24 
 
 		 57 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.903775  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5457  hypothetical protein  88.89 
 
 		 53 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7189  hypothetical protein  77.78 
 
 		 60 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3952  hypothetical protein  77.08 
 
 		 50 aa  77.4  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1844  hypothetical protein  74.42 
 
 		 46 aa  72.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236914  normal  0.0255344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0891  hypothetical protein  72.73 
 
 		 50 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2550  hypothetical protein  76.92 
 
 		 58 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5346  hypothetical protein  60 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1226  hypothetical protein  70 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1820  hypothetical protein  68.18 
 
 		 56 aa  63.5  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.510748 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2010  hypothetical protein  67.57 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5832  hypothetical protein  65 
 
 		 56 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1205  hypothetical protein  68.42 
 
 		 54 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000714156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3021  hypothetical protein  58.33 
 
 		 60 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0257  hypothetical protein  58.14 
 
 		 55 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.66334  normal  0.0569964 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1002  hypothetical protein  64.1 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1752  hypothetical protein  66.67 
 
 		 53 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.790866  decreased coverage  0.000944822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3104  hypothetical protein  60 
 
 		 46 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3546  hypothetical protein  58.14 
 
 		 53 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00336349 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1604  hypothetical protein  58.54 
 
 		 53 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.490705  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45996  predicted protein  49.06 
 
 		 366 aa  57.4  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0448  hypothetical protein  58.97 
 
 		 49 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2525  hypothetical protein  55.81 
 
 		 52 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.269298  normal  0.238571 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1234  Uncharacterized conserved protein UCP037205  63.41 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0334924  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3589  hypothetical protein  55.81 
 
 		 52 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0400  hypothetical protein  58.97 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1342  hypothetical protein  72.73 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0999  hypothetical protein  72.73 
 
 		 46 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.179873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4250  hypothetical protein  57.89 
 
 		 53 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0772  hypothetical protein  63.41 
 
 		 47 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35862  predicted protein  47.17 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0778  hypothetical protein  58.97 
 
 		 46 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32809  predicted protein  54.55 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0902921 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2054  hypothetical protein  56.76 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0150  zinc finger protein  58.33 
 
 		 49 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1251  hypothetical protein  57.14 
 
 		 55 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000641803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1774  hypothetical protein  62.16 
 
 		 53 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1439  hypothetical protein  59.46 
 
 		 51 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.498137  normal  0.11271 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1550  hypothetical protein  52.5 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259641  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1060  hypothetical protein  60.61 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07811  hypothetical protein  51.28 
 
 		 44 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0422  hypothetical protein  58.82 
 
 		 41 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.787118  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1607  hypothetical protein  46.34 
 
 		 53 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0447  hypothetical protein  41.3 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1601  hypothetical protein  64.52 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225631  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15631  hypothetical protein  61.29 
 
 		 39 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.667904  normal  0.580622 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0725  hypothetical protein  61.29 
 
 		 43 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0399  hypothetical protein  41.3 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.964874  hitchhiker  0.000444123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>