33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0399 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0399  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.964874  hitchhiker  0.000444123 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0447  hypothetical protein  94.64 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0400  hypothetical protein  59.09 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0448  hypothetical protein  59.09 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07811  hypothetical protein  56.82 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0772  hypothetical protein  48.89 
 
 		 47 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1002  hypothetical protein  44.44 
 
 		 59 aa  51.2  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5346  hypothetical protein  46.67 
 
 		 55 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3104  hypothetical protein  52.5 
 
 		 46 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0725  hypothetical protein  55.88 
 
 		 43 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0778  hypothetical protein  52.27 
 
 		 46 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15631  hypothetical protein  55.88 
 
 		 39 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.667904  normal  0.580622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0257  hypothetical protein  51.11 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.66334  normal  0.0569964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4250  hypothetical protein  44.19 
 
 		 53 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1752  hypothetical protein  46.34 
 
 		 53 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.790866  decreased coverage  0.000944822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1604  hypothetical protein  37.74 
 
 		 53 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.490705  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1060  hypothetical protein  58.82 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2525  hypothetical protein  52.63 
 
 		 52 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.269298  normal  0.238571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3589  hypothetical protein  52.63 
 
 		 52 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1820  hypothetical protein  47.22 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.510748 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1439  hypothetical protein  48.84 
 
 		 51 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.498137  normal  0.11271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5457  hypothetical protein  35.29 
 
 		 53 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148769 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0422  hypothetical protein  48.72 
 
 		 41 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.787118  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2010  hypothetical protein  42.5 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1342  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1189  hypothetical protein  41.3 
 
 		 53 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.147623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3546  hypothetical protein  42.55 
 
 		 53 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00336349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1059  hypothetical protein  41.3 
 
 		 53 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.917626  normal  0.121737 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1550  hypothetical protein  45.24 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259641  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1844  hypothetical protein  47.62 
 
 		 46 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236914  normal  0.0255344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7189  hypothetical protein  41.03 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0891  hypothetical protein  36.96 
 
 		 50 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12631  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1226  hypothetical protein  41.46 
 
 		 55 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.231582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>