20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2792 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2792  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  221  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3533  hypothetical protein  69.52 
 
 		 107 aa  137  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.344745  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1869  hypothetical protein  69.15 
 
 		 96 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3323  hypothetical protein  51.46 
 
 		 108 aa  121  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.915522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0754  hypothetical protein  54.05 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990253  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2195  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.412323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4530  hypothetical protein  58.16 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4990  hypothetical protein  58.16 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.974642  normal  0.779534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4257  hypothetical protein  52.43 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182743  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5043  hypothetical protein  57 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.902742  normal  0.657032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0270  hypothetical protein  55.67 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00906626  decreased coverage  0.0012708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2812  hypothetical protein  49.44 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2982  hypothetical protein  55.41 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03340  hypothetical protein  51.35 
 
 		 91 aa  67  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0337  hypothetical protein  48.05 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0316  hypothetical protein  48.05 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0327  hypothetical protein  48.05 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04330  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  39.19 
 
 		 408 aa  60.1  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08070  hypothetical protein  44.59 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153782  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0867  hypothetical protein  45.83 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>