20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2195 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2195  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  222  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.412323  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3323  hypothetical protein  52.29 
 
 
108 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.915522  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2792  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0754  hypothetical protein  50.96 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990253  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3533  hypothetical protein  56 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.344745  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1869  hypothetical protein  50.55 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0270  hypothetical protein  55.14 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00906626  decreased coverage  0.0012708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5043  hypothetical protein  53.85 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.902742  normal  0.657032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4530  hypothetical protein  52.88 
 
 
114 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0930841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4990  hypothetical protein  52.88 
 
 
114 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.974642  normal  0.779534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4257  hypothetical protein  50.53 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182743  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0337  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.212597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0316  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0327  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03340  hypothetical protein  43.96 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2812  hypothetical protein  50.63 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2982  hypothetical protein  51.95 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04330  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  42.68 
 
 
408 aa  50.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08070  hypothetical protein  44.05 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153782  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0867  hypothetical protein  42.67 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>