20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3533 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3533  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  223  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.344745  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1869  hypothetical protein  79.79 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2792  hypothetical protein  69.52 
 
 		 106 aa  154  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3323  hypothetical protein  55.88 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.915522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0754  hypothetical protein  57.55 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990253  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2195  hypothetical protein  56 
 
 		 113 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.412323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4530  hypothetical protein  61.22 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4990  hypothetical protein  61.22 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.974642  normal  0.779534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4257  hypothetical protein  54.17 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182743  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0270  hypothetical protein  56.25 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00906626  decreased coverage  0.0012708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5043  hypothetical protein  60.2 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.902742  normal  0.657032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2812  hypothetical protein  47.73 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03340  hypothetical protein  46.43 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0337  hypothetical protein  39.42 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0316  hypothetical protein  39.42 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0327  hypothetical protein  39.42 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2982  hypothetical protein  52.7 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0867  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04330  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  40.54 
 
 		 408 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08070  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153782  normal  0.141313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>