20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1869 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1869  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3533  hypothetical protein  79.79 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.344745  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2792  hypothetical protein  69.15 
 
 		 106 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3323  hypothetical protein  48.91 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.915522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0754  hypothetical protein  52.04 
 
 		 118 aa  87  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990253  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2195  hypothetical protein  50.55 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.412323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4530  hypothetical protein  58.24 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4990  hypothetical protein  58.24 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.974642  normal  0.779534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4257  hypothetical protein  53.33 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182743  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5043  hypothetical protein  58.24 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.902742  normal  0.657032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0270  hypothetical protein  52.27 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00906626  decreased coverage  0.0012708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2812  hypothetical protein  41.98 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03340  hypothetical protein  46.27 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0337  hypothetical protein  45.59 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0316  hypothetical protein  45.59 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0327  hypothetical protein  45.59 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0867  hypothetical protein  49.25 
 
 		 156 aa  48.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2982  hypothetical protein  47.76 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08070  hypothetical protein  44.78 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153782  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04330  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  32.84 
 
 		 408 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>