20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4257 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4257  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  223  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182743  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2792  hypothetical protein  52.43 
 
 		 106 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3323  hypothetical protein  58.42 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.915522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0754  hypothetical protein  55.86 
 
 		 118 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990253  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1869  hypothetical protein  53.33 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3533  hypothetical protein  54.17 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.344745  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0270  hypothetical protein  62.38 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00906626  decreased coverage  0.0012708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4530  hypothetical protein  59.6 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4990  hypothetical protein  59.6 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.974642  normal  0.779534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5043  hypothetical protein  58.82 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.902742  normal  0.657032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2195  hypothetical protein  51.58 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.412323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2982  hypothetical protein  61.33 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0316  hypothetical protein  51.22 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0337  hypothetical protein  51.22 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0327  hypothetical protein  51.22 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03340  hypothetical protein  53.85 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2812  hypothetical protein  45.54 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08070  hypothetical protein  49.33 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153782  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0867  hypothetical protein  50.63 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04330  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  43.59 
 
 		 408 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>