20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0754 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0754  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  228  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990253  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2792  hypothetical protein  55.86 
 
 
106 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3323  hypothetical protein  60 
 
 
108 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.915522  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3533  hypothetical protein  58.49 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.344745  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1869  hypothetical protein  56.12 
 
 
96 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4257  hypothetical protein  53.15 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182743  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4530  hypothetical protein  55.96 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0930841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4990  hypothetical protein  55.96 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.974642  normal  0.779534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2195  hypothetical protein  51.92 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.412323  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5043  hypothetical protein  56.07 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.902742  normal  0.657032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0270  hypothetical protein  55.75 
 
 
128 aa  88.2  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00906626  decreased coverage  0.0012708 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03340  hypothetical protein  47.5 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2812  hypothetical protein  42.68 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0327  hypothetical protein  43.82 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0337  hypothetical protein  43.82 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.212597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0316  hypothetical protein  43.82 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08070  hypothetical protein  42.17 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153782  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2982  hypothetical protein  47.56 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04330  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  37.5 
 
 
408 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0867  hypothetical protein  45.12 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>