250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2759 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2759  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0533783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3085  hypothetical protein  66.67 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2808  phenylacetic acid degradation-related protein  68.55 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2852  hypothetical protein  68.55 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2835  hypothetical protein  68.55 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3355  thioesterase superfamily protein  65.41 
 
 		 133 aa  167  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.402541  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2311  thioesterase superfamily protein  63.11 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11875  hypothetical protein  58.68 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0963448  normal  0.270095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  57.6 
 
 		 129 aa  140  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  56.45 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0870  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 		 139 aa  111  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.222381  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  40.98 
 
 		 136 aa  99  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  44.74 
 
 		 139 aa  99  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 		 135 aa  95.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 142 aa  91.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 138 aa  89  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  40.87 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  37.82 
 
 		 127 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  37.82 
 
 		 127 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 127 aa  84.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  37.5 
 
 		 127 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  37.5 
 
 		 127 aa  84.3  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  37.5 
 
 		 127 aa  84.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  37.5 
 
 		 127 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  37.5 
 
 		 127 aa  84.3  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  37.5 
 
 		 127 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  38.79 
 
 		 147 aa  84  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  36.97 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  36.29 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  36.8 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  38.26 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  38.84 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  37.93 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  36.28 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3484  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  31.58 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  36.94 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  34.95 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  31.58 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  36.94 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  35.58 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  36.19 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  35.58 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  35.58 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  33.98 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  35.58 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  35.58 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  35.58 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  35.34 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  35.58 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  35.34 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  35.58 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  38.3 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3202  thioesterase superfamily protein  39.09 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0886  thioesterase superfamily protein  38.95 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0638  hypothetical protein  36.54 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  34.19 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  33.86 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  33.86 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  33.63 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  33.86 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  33.86 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  33.86 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0695  hypothetical protein  35.58 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0329769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0652  hypothetical protein  35.58 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0711  hypothetical protein  35.58 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0757  hypothetical protein  35.58 
 
 		 137 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  36 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  35.4 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  34.4 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  30.16 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  35.29 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  34.4 
 
 		 145 aa  72  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12960  hypothetical protein  31.75 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.552344  normal  0.38168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  32.73 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1045  hypothetical protein  33.05 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  28 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0617  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>