61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1987 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1987  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  853    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0075  hypothetical protein  40.93 
 
 		 373 aa  252  7e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0208  hypothetical protein  30.81 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.66956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5254  hypothetical protein  23.44 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0899  putative OpgC protein  23.75 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4163  putative OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  24.11 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2532  putative OpgC protein  24.01 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0765  hypothetical protein  24.23 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191126  hitchhiker  0.00877498 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0145  hypothetical protein  24.88 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1104  hypothetical protein  27.03 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1064  putative membrane protein of unknown function  27.98 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0788  putative OpgC protein  22.81 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.107967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4912  putative OpgC protein  21.56 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3644  hypothetical protein  27.91 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4266  OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  22.63 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1295  OpgC protein-like protein  21.82 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1952  acyltransferase family protein  29.31 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0136  acyltransferase 3  22.91 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3339  putative OpgC protein  25.15 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.523015 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2936  putative OpgC protein  25 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0389  hypothetical protein  25.23 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187966  normal  0.347328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4726  hypothetical protein  23.85 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2146  putative OpgC protein  25.15 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1356  acyltransferase family protein  30.45 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2302  putative OpgC protein  26.83 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2784  putative OpgC protein  24.15 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537319  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3260  hypothetical protein  24.38 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0222  acyltransferase 3  22.05 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5546  hypothetical protein  24.54 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.753322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5314  hypothetical protein  24.54 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0258075  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3279  hypothetical protein  26.25 
 
 		 418 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0112  hypothetical protein  24.47 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4043  hypothetical protein  23.9 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0814624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1997  hypothetical protein  27.24 
 
 		 368 aa  53.5  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2806  hypothetical protein  25.48 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1763  hypothetical protein  24.21 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4415  hypothetical protein  23.62 
 
 		 459 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247797  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1455  opgC protein, putative  24.76 
 
 		 431 aa  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0928141  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1032  hypothetical protein  24.29 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.608592  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1288  putative opgC protein  24.29 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0265  hypothetical protein  24.29 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1292  hypothetical protein  24.29 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.721531  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0535  hypothetical protein  24.29 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1372  hypothetical protein  24.29 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3730  hypothetical protein  25.69 
 
 		 681 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2545  hypothetical protein  24.29 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1137  hypothetical protein  26.44 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3642  hypothetical protein  24.49 
 
 		 826 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3041  OpgC protein  26.96 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7260  putative opgC protein  22.5 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1581  hypothetical protein  25.57 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1316  hypothetical protein  25.57 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1967  hypothetical protein  42.86 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5417  hypothetical protein  24.51 
 
 		 375 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1714  hypothetical protein  27.84 
 
 		 409 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5696  hypothetical protein  30.53 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138728 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3760  hypothetical protein  30.53 
 
 		 365 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.500718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4608  hypothetical protein  30.53 
 
 		 365 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4038  hypothetical protein  30.53 
 
 		 365 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.372209 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1233  hypothetical protein  30.53 
 
 		 365 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4870  hypothetical protein  24.39 
 
 		 374 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>