72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1497 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 		 304 aa  635    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  58.1 
 
 		 285 aa  347  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  58.39 
 
 		 342 aa  339  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  58.12 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  58.12 
 
 		 343 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  58.12 
 
 		 343 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  47.39 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  46.72 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  46.72 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  46.72 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  42.01 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  46.03 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  44.57 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  45.1 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  41.61 
 
 		 271 aa  216  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4522  Protein of unknown function DUF2236  40.87 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4848  Protein of unknown function DUF2236  41.2 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4085  Protein of unknown function DUF2236  35.84 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  37.27 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  31.11 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  35.32 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  32.13 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  30.43 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  30.12 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  29.15 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  29.48 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  30.15 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  22.98 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  31.07 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  30.54 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  26.61 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  27.36 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  27.36 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  27.36 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  27.39 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10481  conserved hypothetical protein  24.82 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00162641  normal  0.337442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  23.33 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1496  Protein of unknown function DUF2236  24.63 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  23.01 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  23.01 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  24.35 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  25.74 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  22.69 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  23.58 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  24.7 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  24.83 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  24.7 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  24.7 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  24.49 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  25.32 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  25.99 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  20.59 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  21.17 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  22.53 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  21.89 
 
 		 334 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  22.17 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  21.85 
 
 		 267 aa  52.8  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  22.46 
 
 		 339 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  22.65 
 
 		 351 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  22.44 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0434  hypothetical protein  24.34 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  25.13 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  22.94 
 
 		 317 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  24.44 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  22.48 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  22.48 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  23.74 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  22.18 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  19.89 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  19.89 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  19.89 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>