39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0711 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4732  Integrase catalytic region  99.84 
 
 		 930 bp  1247    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0711    100 
 
 		 3753 bp  7440    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0817    100 
 
 		 4523 bp  2710    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2167    100 
 
 		 2989 bp  1255    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2169  Integrase catalytic region  100 
 
 		 930 bp  1255    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2615  Integrase catalytic region  100 
 
 		 930 bp  1255    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2665    98.42 
 
 		 7798 bp  2236    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2667    98.42 
 
 		 5883 bp  2236    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2811  Integrase catalytic region  100 
 
 		 930 bp  1255    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.675485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3430  Integrase catalytic region  99.53 
 
 		 930 bp  1231    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3614  Integrase catalytic region  100 
 
 		 930 bp  1255    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4663  Integrase catalytic region  100 
 
 		 930 bp  1255    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4701  Integrase catalytic region  100 
 
 		 930 bp  1255    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0368  hypothetical protein  100 
 
 		 363 bp  163  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1219    90.28 
 
 		 2912 bp  87.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.592075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1220  Integrase catalytic region  90.28 
 
 		 939 bp  87.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1224  Integrase catalytic region  90.28 
 
 		 939 bp  87.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.401317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3705    88.89 
 
 		 938 bp  79.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00230013  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2523  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 939 bp  79.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011837  hitchhiker  0.000558279 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5431  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  93.75 
 
 		 831 bp  71.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.15452 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5602  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  93.75 
 
 		 831 bp  71.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.384176  normal  0.976486 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5828  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  93.75 
 
 		 831 bp  71.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313966 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6003  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  93.75 
 
 		 831 bp  71.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000813488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0503    93.62 
 
 		 256 bp  69.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00200956  normal  0.0242434 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3301  Integrase catalytic region  97.37 
 
 		 939 bp  67.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2895  Integrase catalytic region  97.37 
 
 		 939 bp  67.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  89.47 
 
 		 657 bp  65.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5987  hypothetical protein  90.2 
 
 		 765 bp  61.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0892    90 
 
 		 2308 bp  60  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4205    90 
 
 		 2288 bp  60  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4254    90 
 
 		 2279 bp  60  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000923948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4467    90 
 
 		 2251 bp  60  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3003    85.14 
 
 		 10439 bp  60  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21090    94.59 
 
 		 693 bp  58  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3458    88.68 
 
 		 2595 bp  58  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0212053  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2756    100 
 
 		 657 bp  54  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4107  hypothetical protein  93.94 
 
 		 765 bp  50.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.408855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0954  hypothetical protein  84.06 
 
 		 414 bp  50.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119757  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0936  hypothetical protein  84.06 
 
 		 321 bp  50.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>