23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0368 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0368  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  247  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3733  hypothetical protein  48.94 
 
 
339 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4069  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.22 
 
 
442 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.414136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0906  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.22 
 
 
440 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.22 
 
 
440 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4473  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.49 
 
 
439 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2910  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.49 
 
 
439 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000150171  hitchhiker  0.0000194691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.49 
 
 
439 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415277  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1765  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.49 
 
 
439 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00126506  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0461  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.49 
 
 
439 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.49 
 
 
439 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.37 
 
 
545 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.37 
 
 
545 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.37 
 
 
545 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13385  transposase  44.9 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172054  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22250  transposase family protein  36.08 
 
 
457 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26440  transposase family protein  32.76 
 
 
428 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22120  transposase family protein  32.76 
 
 
428 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05360  transposase family protein  32.76 
 
 
428 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20460  transposase  34.29 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0995165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19680  transposase  34.29 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16150  transposase  34.29 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.14 
 
 
562 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>