57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1219 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2446  Integrase catalytic region  97.87 
 
 		 939 bp  1703    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000102431  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1224  Integrase catalytic region  100 
 
 		 939 bp  1861    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.401317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1223  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 327 bp  648    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1221  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 327 bp  648    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.774632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1220  Integrase catalytic region  100 
 
 		 939 bp  1861    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1219    100 
 
 		 2912 bp  5773    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.592075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2523  Integrase catalytic region  93.72 
 
 		 939 bp  1394    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011837  hitchhiker  0.000558279 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3705    93.5 
 
 		 938 bp  1370    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00230013  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2553    88.89 
 
 		 673 bp  618  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287638  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2447  transposase IS3/IS911 family protein  97.25 
 
 		 327 bp  577  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000211632  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3708  transposase IS3/IS911 family protein  91.99 
 
 		 333 bp  387  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0112916  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2520  transposase IS3/IS911 family protein  91.99 
 
 		 333 bp  387  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000790886  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2877  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 1494 bp  89.7  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0711    90.28 
 
 		 3753 bp  87.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2167    90.28 
 
 		 2989 bp  87.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2169  Integrase catalytic region  90.28 
 
 		 930 bp  87.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2615  Integrase catalytic region  90.28 
 
 		 930 bp  87.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2811  Integrase catalytic region  90.28 
 
 		 930 bp  87.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.675485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3430  Integrase catalytic region  90.28 
 
 		 930 bp  87.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3614  Integrase catalytic region  90.28 
 
 		 930 bp  87.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4663  Integrase catalytic region  90.28 
 
 		 930 bp  87.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4701  Integrase catalytic region  90.28 
 
 		 930 bp  87.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4732  Integrase catalytic region  90.28 
 
 		 930 bp  87.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3301  Integrase catalytic region  83.78 
 
 		 939 bp  77.8  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2895  Integrase catalytic region  83.78 
 
 		 939 bp  77.8  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0503    93.62 
 
 		 256 bp  69.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00200956  normal  0.0242434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7081  hypothetical protein  86.08 
 
 		 1005 bp  69.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3894  integrase catalytic subunit  86.67 
 
 		 1497 bp  69.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0936  hypothetical protein  85.19 
 
 		 321 bp  65.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0954  hypothetical protein  85.19 
 
 		 414 bp  65.9  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119757  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0623    93.18 
 
 		 327 bp  63.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4702  transposase IS3/IS911 family protein  94.74 
 
 		 327 bp  60  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.677294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4733  transposase IS3/IS911 family protein  94.74 
 
 		 327 bp  60  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4664  transposase IS3/IS911 family protein  94.74 
 
 		 327 bp  60  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3613  transposase IS3/IS911 family protein  94.74 
 
 		 327 bp  60  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3431  transposase IS3/IS911 family protein  94.74 
 
 		 327 bp  60  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2810  transposase IS3/IS911 family protein  94.74 
 
 		 327 bp  60  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.978758  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2616  transposase IS3/IS911 family protein  94.74 
 
 		 327 bp  60  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2168  transposase IS3/IS911 family protein  94.74 
 
 		 327 bp  60  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226966  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0715    94.74 
 
 		 327 bp  60  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3300  transposase IS3/IS911 family protein  94.44 
 
 		 330 bp  56  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2896  transposase IS3/IS911 family protein  94.44 
 
 		 330 bp  56  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  83.33 
 
 		 900 bp  56  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  83.33 
 
 		 900 bp  56  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  92.5 
 
 		 324 bp  56  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  90.91 
 
 		 837 bp  56  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2665    90.7 
 
 		 7798 bp  54  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2667    90.7 
 
 		 5883 bp  54  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0599    84 
 
 		 520 bp  54  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 324 bp  52  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5604  hypothetical protein  96.55 
 
 		 336 bp  50.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.689274  normal  0.6989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0064    100 
 
 		 594 bp  50.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  100 
 
 		 1182 bp  50.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5429  hypothetical protein  96.55 
 
 		 336 bp  50.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.308661 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5826  hypothetical protein  96.55 
 
 		 336 bp  50.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.27986 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6005  hypothetical protein  96.55 
 
 		 336 bp  50.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000975175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2518  sulfatase  100 
 
 		 2298 bp  50.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.606572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>