23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3832 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 660 aa  1286    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  72.38 
 
 		 656 aa  825    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4207  flagellar hook-length control protein  54.25 
 
 		 604 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0416  hypothetical protein  36.03 
 
 		 479 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3106  flagellar hook-length control protein  37.99 
 
 		 479 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3432  flagellar hook-length control protein  36.9 
 
 		 570 aa  103  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  31.49 
 
 		 602 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  27.78 
 
 		 580 aa  55.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  35.11 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  28 
 
 		 552 aa  51.6  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1117  flagellar hook-length control protein  35.44 
 
 		 407 aa  50.8  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  32.11 
 
 		 495 aa  47.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0855  flagellar hook-length control protein-like protein  27.27 
 
 		 723 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  39.29 
 
 		 390 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  34.57 
 
 		 393 aa  46.6  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0053  hypothetical protein  27.45 
 
 		 383 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1501  flagellar hook-length control protein  22.9 
 
 		 533 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  39.58 
 
 		 438 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0189  flagellar hook-length control protein  32.14 
 
 		 352 aa  45.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3572  flagellar hook-length control protein  30.99 
 
 		 367 aa  44.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5062  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 526 aa  44.3  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0471  flagellar hook-length control protein  33.82 
 
 		 528 aa  44.3  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0248  flagellar hook-length control protein  26.44 
 
 		 631 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0205536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>