134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3828 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3828  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 
174 aa  341  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3912  flagellar basal body-associated protein FliL  95.98 
 
 
172 aa  283  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0271549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3436  flagellar basal body-associated protein FliL  60.57 
 
 
177 aa  198  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3294  flagellar basal body-associated protein FliL  55.11 
 
 
183 aa  174  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4203  flagellar basal body-associated protein FliL  53.71 
 
 
166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3101  flagellar basal body-associated protein FliL  56.07 
 
 
174 aa  163  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0420  flagellar protein FliL  60.74 
 
 
173 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.706283  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  39.43 
 
 
167 aa  104  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  39.49 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1741  flagellar basal body-associated protein FliL  37.3 
 
 
178 aa  94.7  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0879  flagellar basal body-associated protein FliL  32.41 
 
 
179 aa  92.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1407  flagellar basal body-associated protein FliL  36.51 
 
 
178 aa  92.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.875078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  30.86 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  27.43 
 
 
175 aa  91.7  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1595  flagellar basal body-associated protein FliL  35.71 
 
 
178 aa  91.3  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1630  flagellar basal body-associated protein FliL  34.97 
 
 
179 aa  90.9  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 
178 aa  90.9  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0840  flagellar basal body-associated protein FliL  28.95 
 
 
187 aa  89  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0271  flagellar basal body-associated protein FliL  35.04 
 
 
183 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2212  flagellar basal body-associated protein FliL  32.59 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3586  flagellar protein FliL  31.61 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.89846  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0373  flagellar basal body-associated protein FliL  33.88 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2914  flagellar basal body-associated protein FliL  33.94 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.667538  normal  0.215161 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  32.99 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  33.52 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0860  flagellar protein (FliL)-like protein  29.05 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  30.17 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0571  flagellar basal body-associated protein  35.34 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  28.4 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1637  flagellar basal body-associated protein FliL  34.78 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.600168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0769  flagellar basal body-associated protein FliL  36.17 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0783  flagellar basal body-associated protein FliL  29.79 
 
 
159 aa  61.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  29.45 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  30.23 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0767  flagellar basal body-associated protein FliL  30.17 
 
 
187 aa  58.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.577701  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  32.35 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3222  flagellar basal body-associated protein FliL  36.09 
 
 
174 aa  58.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0029  flagellar basal body-associated protein FliL  32.04 
 
 
177 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0041  flagellar basal body-associated protein FliL  32.04 
 
 
177 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0060  flagellar basal body-associated protein FliL  32.04 
 
 
177 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  27.75 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  32.02 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  30.59 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0044  flagellar basal body-associated protein FliL  31.07 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3225  flagellar basal body-associated protein FliL  31.07 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0556  flagellar basal body-associated protein FliL  29.79 
 
 
199 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0033  flagellar basal body-associated protein FliL  30.1 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  30.59 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0413  flagellar basal body-associated protein FliL  30.08 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0042  flagellar basal body-associated protein FliL  30.1 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200475  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2765  flagellar basal body-associated protein FliL  27.61 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0239  flagellar basal body-associated protein FliL  27.61 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16760  flagellar basal body-associated protein FliL  31.25 
 
 
145 aa  55.5  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431059  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  30.54 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  30.54 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3498  flagellar basal body-associated protein FliL  27.61 
 
 
165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1868  flagellar basal body-associated protein FliL  27.61 
 
 
165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  27.61 
 
 
165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2684  flagellar basal body-associated protein FliL  27.61 
 
 
165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1404  flagellar basal body-associated protein FliL  30.77 
 
 
154 aa  54.7  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.28248  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  25.73 
 
 
172 aa  54.7  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1119  flagellar basal body-associated protein FliL  29.05 
 
 
208 aa  54.3  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  30.41 
 
 
175 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1606  flagellar basal body-associated protein FliL  29.44 
 
 
158 aa  54.3  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.0493559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2735  flagellar basal body-associated protein FliL  34 
 
 
171 aa  54.3  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  27.13 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  27.98 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1022  flagellar basal body-associated protein FliL  30.49 
 
 
200 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2302  flagellar basal body-associated protein FliL  29.61 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2036  flagellar basal body-associated protein FliL  30.21 
 
 
148 aa  52.4  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.339688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  28.73 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  30.89 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0706  flagellar basal body-associated protein FliL  27.98 
 
 
185 aa  52  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1348  flagellar basal body-associated protein FliL  33.14 
 
 
174 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.298791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  30.51 
 
 
166 aa  52  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1433  flagellar basal body-associated protein FliL  31.68 
 
 
197 aa  51.6  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1188  flagellar basal body-associated protein FliL  29.59 
 
 
173 aa  52  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2291  flagellar basal body-associated protein FliL  32.6 
 
 
175 aa  51.6  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1682  flagellar basal body-associated protein FliL  28.71 
 
 
135 aa  51.6  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5297  flagellar biosynthesis protein; flagellar basal body-associated protein  30.61 
 
 
171 aa  51.2  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.687162  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1164  flagellar basal body-associated protein FliL  29 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.372404  normal  0.0336547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  26.71 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4389  flagellar basal body-associated protein FliL  27.34 
 
 
222 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0379  flagellar basal body-associated protein FliL  28.93 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24170  Flagellar basal body-associated protein  32 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0209551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0644  flagellar basal body-associated protein FliL  27.96 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3676  flagellar basal body-associated protein FliL  32.24 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.814795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1288  flagellar basal body-associated protein FliL  31.76 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0974  flagellar basal body-associated protein FliL  29.29 
 
 
161 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0154404  normal  0.0446936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1367  flagellar basal body-associated protein FliL  28.96 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1756  flagellar basal body-associated protein FliL  28.26 
 
 
161 aa  49.3  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  32.24 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4199  flagellar basal body-associated protein FliL  25.45 
 
 
166 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.742849  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3776  flagellar basal body-associated protein FliL  30.39 
 
 
166 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.368254  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3075  flagellar basal body-associated protein FliL  30.1 
 
 
190 aa  47.4  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3951  flagellar basal body-associated protein FliL  28.16 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  27.61 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1366  flagellar basal body-associated protein FliL  31.62 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02881  flagellar basal body-associated protein FliL  26.11 
 
 
179 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2937  flagellar basal body-associated protein FliL  26.47 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>