25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2588 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2588  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  517  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2091  hypothetical protein  75 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.487971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1638  hypothetical protein  71.59 
 
 		 264 aa  347  8e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1659  hypothetical protein  60.98 
 
 		 263 aa  288  8e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1499  hypothetical protein  50.38 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1401  hypothetical protein  49.03 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.441755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  29.66 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  30.4 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  28.3 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  27.65 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  27.34 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0667  hypothetical protein  27.71 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  23.68 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0633  hypothetical protein  27.23 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  26.32 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5300  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  23.4 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  23.01 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0678  hypothetical protein  27.27 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1587  hypothetical protein  26.62 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1612  putative efflux ABC transporter, permease protein PilI  26.62 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1484  hypothetical protein  25.23 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0382  hypothetical protein  25.56 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1808  hypothetical protein  30.97 
 
 		 277 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.877505  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  41.33 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>