39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3591 on replicon NC_013412
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013412  GYMC61_3591  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 156 aa  323  7e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0129413  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3454  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  77.56 
 
 		 156 aa  262  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.594088  normal  0.915098 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2260  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  54.03 
 
 		 202 aa  120  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253408  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1134  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.6 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  33.82 
 
 		 575 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0036  cell wall biogenesis enzyme-like protein  32.14 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0460  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.74 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2619  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  37.74 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0486  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  37.74 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.46 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.646468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0394  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  38.46 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2906  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.46 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0048  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  36.79 
 
 		 283 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1719  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  36.79 
 
 		 283 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3153  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  36.79 
 
 		 283 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0910994  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2824  hypothetical protein  36.79 
 
 		 321 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3647  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  36.79 
 
 		 321 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3630  hypothetical protein  36.79 
 
 		 321 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3623  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  36.79 
 
 		 321 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3576  hypothetical protein  38.46 
 
 		 203 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2952  hypothetical protein  36.79 
 
 		 321 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1218  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.77 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1679  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.43 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2690  L-alanyl-D-glutamate peptidase  31.78 
 
 		 281 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2620  L-alanyl-D-glutamate peptidase  30.53 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1933  phage capsid scaffolding protein (GpO)  33.83 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.792365  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4924  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.61 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05510  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family  31.78 
 
 		 292 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1278  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.238207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3474  putative phagelysin  27.08 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.352563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01942  hypothetical protein  34.95 
 
 		 282 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.344173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2191  hypothetical protein  32.35 
 
 		 282 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2506  hypothetical protein  27.74 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4929  hypothetical protein  28.89 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2334  bacteriophage P7 related protein  27.07 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124711  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  38.38 
 
 		 208 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1046  hypothetical protein  48.78 
 
 		 407 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0412  M15 family peptidase  28.57 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0476  putative phage-related protein  28.57 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.877845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>