23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4924 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4924  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178814 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2824  hypothetical protein  90.09 
 
 		 321 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3153  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  90.09 
 
 		 283 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0910994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3647  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  90.09 
 
 		 321 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3623  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  90.09 
 
 		 321 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1719  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  90.09 
 
 		 283 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0048  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  90.09 
 
 		 283 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2952  hypothetical protein  90.57 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3630  hypothetical protein  90.09 
 
 		 321 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0394  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  90.09 
 
 		 242 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0486  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  90.09 
 
 		 281 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430323  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2619  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  90.09 
 
 		 281 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2906  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  90.57 
 
 		 281 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  90.09 
 
 		 281 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.646468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0460  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  89.62 
 
 		 281 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3576  hypothetical protein  91.58 
 
 		 203 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_003296  RS01942  hypothetical protein  73.46 
 
 		 282 aa  299  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.344173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2191  hypothetical protein  64.43 
 
 		 282 aa  245  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05510  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family  49 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128539  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3591  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.61 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0129413  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3454  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.64 
 
 		 156 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.594088  normal  0.915098 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1134  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.87 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  31.25 
 
 		 575 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>