28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0421 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.646468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0460  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  98.22 
 
 		 281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2619  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  97.51 
 
 		 281 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0486  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  97.51 
 
 		 281 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430323  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0394  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  99.59 
 
 		 242 aa  497  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2906  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  95.75 
 
 		 281 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2952  hypothetical protein  85.05 
 
 		 321 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3153  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  86.12 
 
 		 283 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0910994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0048  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  86.12 
 
 		 283 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1719  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  86.12 
 
 		 283 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2824  hypothetical protein  87.11 
 
 		 321 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3647  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  87.11 
 
 		 321 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3623  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  87.11 
 
 		 321 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3630  hypothetical protein  87.11 
 
 		 321 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3576  hypothetical protein  99.01 
 
 		 203 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4924  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  90.09 
 
 		 213 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178814 
 
 
-
 
NC_003296  RS01942  hypothetical protein  61.09 
 
 		 282 aa  315  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.344173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2191  hypothetical protein  52.46 
 
 		 282 aa  264  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05510  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family  40.43 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128539  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3591  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.46 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0129413  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3454  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.55 
 
 		 156 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.594088  normal  0.915098 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1134  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.71 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  29.46 
 
 		 575 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2790  hypothetical phage-related protein  30.93 
 
 		 113 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2926  hypothetical protein  30.93 
 
 		 113 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.99493e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3482  hypothetical protein  30.93 
 
 		 113 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  hitchhiker  0.0000000000000269752 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2260  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.57 
 
 		 202 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253408  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0036  cell wall biogenesis enzyme-like protein  37.7 
 
 		 146 aa  42  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>