37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2260 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2260  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253408  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3591  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  54.03 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0129413  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3454  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  52.76 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.594088  normal  0.915098 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1134  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.73 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0036  cell wall biogenesis enzyme-like protein  29.71 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1278  hypothetical protein  30.88 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.238207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1679  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.28 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05510  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family  27.7 
 
 		 292 aa  52.4  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128539  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1933  phage capsid scaffolding protein (GpO)  28.57 
 
 		 294 aa  52  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.792365  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4929  hypothetical protein  31.5 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  37.18 
 
 		 575 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1218  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.59 
 
 		 131 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2506  hypothetical protein  33.08 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01942  hypothetical protein  30 
 
 		 282 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.344173 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0476  putative phage-related protein  27.69 
 
 		 133 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.877845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3153  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.69 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0910994  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1902  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1968  peptidase  40 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1185  M15 family peptidase  28.12 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0048  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.69 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1719  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.69 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0412  M15 family peptidase  27.69 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3623  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.69 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3647  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.69 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2824  hypothetical protein  25.69 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3630  hypothetical protein  25.69 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2952  hypothetical protein  25.69 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2191  hypothetical protein  30 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0486  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  30.61 
 
 		 281 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430323  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2619  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  30.61 
 
 		 281 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314166  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0460  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.77 
 
 		 281 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1102  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.46 
 
 		 269 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0394  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  30.61 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2906  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.77 
 
 		 281 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.61 
 
 		 281 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.646468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2334  bacteriophage P7 related protein  31.36 
 
 		 131 aa  42  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124711  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3576  hypothetical protein  30.77 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>