32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_05510 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_05510  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family  100 
 
 		 292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128539  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01942  hypothetical protein  45.45 
 
 		 282 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.344173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2191  hypothetical protein  41.45 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.94 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.646468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0394  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  43.48 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3153  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  45.5 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0910994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0048  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  45.5 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1719  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  45.5 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2824  hypothetical protein  45.5 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3647  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  45.5 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3623  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  45.5 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3630  hypothetical protein  45.5 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0486  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  41.13 
 
 		 281 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430323  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2619  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  41.13 
 
 		 281 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314166  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4924  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49 
 
 		 213 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0460  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.13 
 
 		 281 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2952  hypothetical protein  45.02 
 
 		 321 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2906  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.34 
 
 		 281 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3576  hypothetical protein  46.94 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3591  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.78 
 
 		 156 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0129413  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3454  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.33 
 
 		 156 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.594088  normal  0.915098 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2260  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.7 
 
 		 202 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253408  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0036  cell wall biogenesis enzyme-like protein  37.7 
 
 		 146 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2334  bacteriophage P7 related protein  34.38 
 
 		 131 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  38.71 
 
 		 575 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0476  putative phage-related protein  30.93 
 
 		 133 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.877845  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0412  M15 family peptidase  32.32 
 
 		 133 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1185  M15 family peptidase  30.85 
 
 		 133 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  32 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4929  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2620  L-alanyl-D-glutamate peptidase  31.58 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  22.96 
 
 		 324 aa  42.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>