20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1679 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1679  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 230 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4051  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.98 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3454  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.45 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.594088  normal  0.915098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0412  M15 family peptidase  35.43 
 
 		 133 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3591  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.43 
 
 		 156 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0129413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2751  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.75 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2260  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.28 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0476  putative phage-related protein  32.35 
 
 		 133 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.877845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1185  M15 family peptidase  32.35 
 
 		 133 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2191  hypothetical protein  28.93 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.71 
 
 		 391 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0036  cell wall biogenesis enzyme-like protein  23.4 
 
 		 146 aa  45.1  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0578  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.89 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1644  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 		 407 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 422 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.9 
 
 		 433 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2334  bacteriophage P7 related protein  31.78 
 
 		 131 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124711  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  38.78 
 
 		 417 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  46.51 
 
 		 424 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 322 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>