More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2452 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2452  late competence protein ComER  100 
 
 		 273 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00347201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0999  late competence protein ComER  72.69 
 
 		 272 aa  401  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4225  late competence protein ComER  55.51 
 
 		 275 aa  332  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.755037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4350  late competence protein ComER  55.51 
 
 		 275 aa  332  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4179  late competence protein ComER  55.15 
 
 		 275 aa  332  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0789  late competence protein ComER  55.51 
 
 		 275 aa  331  9e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0125118  hitchhiker  0.000000168646 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4448  late competence protein ComER  55.51 
 
 		 275 aa  331  9e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0500501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4409  late competence protein ComER  55.15 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4461  late competence protein ComER  54.78 
 
 		 275 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000265732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3054  late competence protein ComER  54.98 
 
 		 283 aa  326  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4073  late competence protein ComER  54.58 
 
 		 265 aa  316  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4063  late competence protein ComER  54.58 
 
 		 265 aa  315  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00294057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4554  late competence protein ComER  54.58 
 
 		 265 aa  315  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00155928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0740  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.83 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1294  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.13 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0466034  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1560  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.71 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1591  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.71 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.542634  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1065  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.14 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.378355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.61 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.81 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.4 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.67 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.28 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.42 
 
 		 275 aa  92.4  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.97 
 
 		 271 aa  92  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.46 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.94 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.64 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.94 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.94 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  28.23 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.94 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.94 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.3 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.54 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.53 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.72 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.02 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.04 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.98 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.39 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.61 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.61 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.61 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.81 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.61 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.81 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.75 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.13 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.81 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.69 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.61 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  25.61 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.61 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.53 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.61 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.78 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.39 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.61 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.7 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.51 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.23 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.47 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.8 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1990  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.58 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307416  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.86 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.42 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.61 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.1 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.53 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.7 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  24.1 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.28 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.51 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.72 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.1 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.67 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.17 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.91 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.27 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.12 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.62 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.86 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  24 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.27 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.53 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0182  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.43 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.2 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.02 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.86 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.46 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.8 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.1 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.72 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.4 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3348  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.51 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.51 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>