23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2191 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2191  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1368  peptidoglycan-binding protein  34.57 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3803  lysM domain protein  35.19 
 
 		 159 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  hitchhiker  1.81276e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1542  lysM domain protein  34.57 
 
 		 159 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1612  lysM domain-containing protein  33.33 
 
 		 159 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000378837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1648  lysM domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000383151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1507  lysm domain-containing protein  33.95 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000123436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1396  lysM domain-containing protein  33.95 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000873032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1409  peptidoglycan-binding LysM  32.1 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000791474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1210  peptidoglycan-binding LysM  32.34 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000146268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0438  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.46 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1369  peptidoglycan-binding protein  33.33 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.6403400000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1581  lysM domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05729e-36 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 		 516 aa  47.8  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  33.71 
 
 		 393 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 298 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  29.2 
 
 		 474 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  44.44 
 
 		 583 aa  42.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1048  elastin binding protein, putative  42.86 
 
 		 460 aa  42.4  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 289 aa  42  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6909  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  30.3 
 
 		 619 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  0.152044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 301 aa  41.2  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 		 539 aa  41.2  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>