22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1168 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1168  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.452749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2270  Allergen V5/Tpx-1 family protein  61.46 
 
 		 208 aa  236  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0796  Allergen V5/Tpx-1 related protein  64.8 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1216  SCP-like extracellular  55.25 
 
 		 205 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3057  SCP-like extracellular  55.25 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0292  Allergen V5/Tpx-1 family protein  50.96 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4778  Allergen V5/Tpx-1 related  44.12 
 
 		 233 aa  167  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4777  Allergen V5/Tpx-1 related  44.15 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.99 
 
 		 242 aa  148  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1620  Allergen V5/Tpx-1 related  48.82 
 
 		 217 aa  141  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  43.58 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1475  SCP-like extracellular  47.43 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0179083 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0824  putative lipoprotein  35.38 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000106095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5182  SCP-like extracellular  33.17 
 
 		 309 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3270  allergen V5/TPX-1 family protein  25.25 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  35.48 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.04 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  31.03 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.63 
 
 		 156 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  33.63 
 
 		 156 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  34.69 
 
 		 301 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  28.32 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>