31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1154 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1154  surface protein  100 
 
 		 4713 aa  9209    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3762  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.82 
 
 		 5342 aa  548  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0652  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1373 aa  191  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0788279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  25.72 
 
 		 12741 aa  178  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  27.78 
 
 		 8980 aa  147  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0651  hypothetical protein  30.46 
 
 		 3954 aa  113  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1047  hypothetical protein  25.27 
 
 		 6062 aa  112  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  26.18 
 
 		 15831 aa  107  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  28.93 
 
 		 14829 aa  76.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0616  parallel beta-helix repeat-containing protein  25 
 
 		 20646 aa  70.5  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0379  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.31 
 
 		 1073 aa  67.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0161593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.71 
 
 		 3537 aa  63.9  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.22 
 
 		 3535 aa  60.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.37 
 
 		 3419 aa  58.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.36 
 
 		 3299 aa  58.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2196  hemolysin-type calcium-binding region  24.34 
 
 		 15245 aa  55.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.69 
 
 		 1081 aa  53.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  35.14 
 
 		 2679 aa  53.5  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.64 
 
 		 1570 aa  53.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  29.86 
 
 		 1003 aa  52.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  28.7 
 
 		 1058 aa  52.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5479  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.33 
 
 		 816 aa  51.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.57 
 
 		 800 aa  51.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.58 
 
 		 607 aa  51.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.57 
 
 		 985 aa  49.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1755  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.19 
 
 		 965 aa  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.8 
 
 		 1349 aa  49.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.14 
 
 		 1391 aa  48.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0053  filamentous haemagglutinin-like protein  31.09 
 
 		 811 aa  48.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.710253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.77 
 
 		 4500 aa  47.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1390  filamentous haemagglutinin-like protein  24.64 
 
 		 1033 aa  47.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.379495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>