31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4122 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_4031  phosphate-selective porin O and P  87.5 
 
 		 400 aa  730    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4122  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 399 aa  818    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.556284 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0451  phosphate-selective porin O and P  75.31 
 
 		 401 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0445  phosphate-selective porin O and P  75.31 
 
 		 401 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2939  outer membrane porin FmdC, putative  67.49 
 
 		 406 aa  567  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0532  phosphate-selective porin O and P  63.86 
 
 		 415 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000620522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1204  phosphate-selective porin O and P  64.76 
 
 		 403 aa  532  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0072  phosphate-selective porin O and P  40.8 
 
 		 396 aa  259  7e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1175  outer membrane porin FmdC, putative  34.15 
 
 		 489 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000392921  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1417  hypothetical protein  25.54 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0510  phosphate-selective porin O and P  24.38 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2000  hypothetical protein  26.54 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1253  hypothetical protein  25.68 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00910104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0983  hypothetical protein  24.07 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0073  phosphate-selective porin O and P  23.04 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5810  hypothetical protein  24.77 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960319 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0462  hypothetical protein  24.42 
 
 		 530 aa  53.1  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.369233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4128  phosphate-selective porin O and P  23.43 
 
 		 426 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.611373 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0960  hypothetical protein  22.26 
 
 		 445 aa  49.7  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000766698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0272  hypothetical protein  22.71 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0939  hypothetical protein  21.34 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000462454  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0056  hypothetical protein  21.15 
 
 		 459 aa  46.6  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000444943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2588  phosphate-selective porin O and P  25 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4013  phosphate-selective porin O and P  30.89 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4382  phosphate-selective porin O and P  30.89 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2169  phosphate-selective porin O and P  30.83 
 
 		 475 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0801  phosphate-selective porin O and P  28.78 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.167579  normal  0.676096 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0157  hypothetical protein  24.8 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1473  hypothetical protein  24.67 
 
 		 494 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00085768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4495  phosphate-selective porin O and P  29.84 
 
 		 554 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0892  phosphate-selective porin O and P  29.06 
 
 		 511 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>