21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3057 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3057  SCP-like extracellular  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1216  SCP-like extracellular  93.17 
 
 		 205 aa  374  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2270  Allergen V5/Tpx-1 family protein  61.42 
 
 		 208 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0292  Allergen V5/Tpx-1 family protein  55.61 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1168  hypothetical protein  55.25 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.452749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0796  Allergen V5/Tpx-1 related protein  53.3 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4778  Allergen V5/Tpx-1 related  44.51 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4777  Allergen V5/Tpx-1 related  41.67 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.32 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  39.56 
 
 		 293 aa  131  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0824  putative lipoprotein  39.25 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000106095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1475  SCP-like extracellular  43.6 
 
 		 192 aa  117  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0179083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1620  Allergen V5/Tpx-1 related  41.42 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5182  SCP-like extracellular  39.04 
 
 		 309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3270  allergen V5/TPX-1 family protein  33.63 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.63 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  33.63 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  30.23 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  30.53 
 
 		 162 aa  45.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.04 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  31.96 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>