More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2515 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  55.28 
 
 		 541 aa  635    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  60.48 
 
 		 539 aa  693    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  60.3 
 
 		 539 aa  695    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  61.78 
 
 		 541 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  60.94 
 
 		 541 aa  663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  60.3 
 
 		 539 aa  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  97.4 
 
 		 539 aa  1078    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  55.74 
 
 		 542 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  58.55 
 
 		 541 aa  667    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  56.32 
 
 		 541 aa  662    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  61.24 
 
 		 540 aa  689    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  56.98 
 
 		 541 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  55.74 
 
 		 542 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  63.82 
 
 		 541 aa  724    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  55.18 
 
 		 542 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 539 aa  1104    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  60.19 
 
 		 539 aa  688    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  76.81 
 
 		 546 aa  872    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  57.06 
 
 		 540 aa  639    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  59.81 
 
 		 534 aa  678    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  55.37 
 
 		 569 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  58.92 
 
 		 541 aa  672    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  57.84 
 
 		 545 aa  673    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  65.12 
 
 		 541 aa  743    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  55.18 
 
 		 542 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  61.13 
 
 		 541 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  57.31 
 
 		 541 aa  653    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  55.74 
 
 		 542 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  55.64 
 
 		 536 aa  622  1e-177  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  55.66 
 
 		 540 aa  621  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  55.7 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  52.79 
 
 		 542 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  54.17 
 
 		 526 aa  603  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  53.33 
 
 		 524 aa  596  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  57.47 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  40.77 
 
 		 588 aa  399  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  33.12 
 
 		 466 aa  236  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.04 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  33.26 
 
 		 482 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  31.8 
 
 		 457 aa  226  9e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  30.96 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.3 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.07 
 
 		 479 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.07 
 
 		 479 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  29.84 
 
 		 479 aa  220  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  29.84 
 
 		 479 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.02 
 
 		 471 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.84 
 
 		 479 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.84 
 
 		 479 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.84 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.84 
 
 		 479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.84 
 
 		 479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  29.53 
 
 		 479 aa  217  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  30.32 
 
 		 479 aa  217  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.08 
 
 		 475 aa  210  7e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  32.12 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  30.85 
 
 		 482 aa  203  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.25 
 
 		 475 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  29.51 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  30.93 
 
 		 499 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  29.42 
 
 		 478 aa  179  8e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  30.37 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  27.08 
 
 		 465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  26.38 
 
 		 449 aa  174  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1454  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  30.77 
 
 		 480 aa  173  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  29.35 
 
 		 475 aa  170  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  27.8 
 
 		 477 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  31.57 
 
 		 476 aa  170  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  31.23 
 
 		 486 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  31.23 
 
 		 486 aa  170  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  31.23 
 
 		 486 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  31.23 
 
 		 486 aa  170  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  31.23 
 
 		 486 aa  170  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  31.23 
 
 		 486 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  31.23 
 
 		 486 aa  170  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  31.23 
 
 		 486 aa  170  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1729  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  29.66 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  28.92 
 
 		 480 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  28.96 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4691  aldehyde dehydrogenase  28.1 
 
 		 486 aa  167  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  28.05 
 
 		 498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  27.94 
 
 		 468 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  29.79 
 
 		 485 aa  164  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  27.78 
 
 		 486 aa  163  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  29.45 
 
 		 480 aa  163  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.27 
 
 		 480 aa  163  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  27.98 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0509  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (acylating)  28.6 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0997846  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.78 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38450  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  29.2 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  28.57 
 
 		 479 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  28.36 
 
 		 479 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  28.69 
 
 		 497 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  29.6 
 
 		 489 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  27.18 
 
 		 505 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  28.57 
 
 		 479 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  30.54 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  29.19 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  30 
 
 		 516 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  28.36 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>